Valga Piirkonna Keskkonnakeskuse haldusalasse jäävad järgmised vallad ja linnad:

- Valga linn
- Tõrva linn
- Helme vald
- Õru vald
- Hummuli vald
- Karula vald
- Otepää vald
- Põdrala vald
- Puka vald
- Sangaste vald
- Taheva vald
- Tõlliste vald
- Palupera vald